混雑は朝の通勤時間帯だけにとどまりません。日暮里舎人ライナーの夕方・帰宅ラッシュは、18時00分から20時30分頃にかけてピークを迎えます。朝ラッシュのように「特定の1時間に全員が集中する」わけではないため、乗車見送りが連発するほどの破綻は少ないものの、始発駅である日暮里駅と西日暮里駅から乗車する下り列車は常にすし詰め状態です。
特に注意が必要なのが、日暮里舎人ライナーの西日暮里駅での乗り換え混雑です。西日暮里駅は、JR山手線・京浜東北線および東京メトロ千代田線からの乗り換え客が大量に流入します。地上から高架ホームへと続く連絡通路や階段・エスカレーターが狭いため、帰宅ラッシュ時はホームに上がる手前で人の滞留が発生します。
日暮里駅で座席がすべて埋まり、立ち客も多く乗った状態で西日暮里駅に到着するため、西日暮里から乗車する乗客は奥へ詰めなければならず、ドア付近で強い押し合いが生じます。金曜日の夜や雨天時にはこの傾向が顕著になり、終点近くまで混雑が緩和しないケースも珍しくありません。
