眼科的検査で眼球に異常が見当たらない場合、脳や自律神経のトラブルを精査しなければなりません。
代表的な要因が、偏頭痛に伴う光過敏と吐き気です。脳の三叉神経が刺激されて血管が拡張する際、光や音に対する感覚閾値が著しく低下し、通常の照明すら刺すような苦痛に感じられます。頭痛の直前に目がチカチカする光が眩しい現象（閃輝暗点）が現れ、視界の一部にギザギザとした光の波が広がった後にズキズキとした拍動性の頭痛と吐き気が襲うケースは典型的なパターンです。
慢性的なストレスや過労が重なっている人は、自律神経失調症で眩しい感覚を覚えることも珍しくありません。自律神経は瞳孔の開閉（散瞳・縮瞳）を無意識にコントロールしています。交感神経と副交感神経のバランスが崩れると、明るい場所でも瞳孔が適切に絞られず、必要以上の光が網膜に流れ込んで日常的に強い眩しさを感じてしまいます。
