白糸の滝が国内外の旅人を魅了してやまない最大の秘密は、「滝の成り立ちそのものが一般的な滝と根本的に異なる」という点にあります。日本国内にある大半の滝は、川の流れが断崖から落下する構造ですが、白糸の滝の上流には大きな河川が存在しません。水が流れ落ちているのは、岩壁そのものの隙間からです。
この特異な景観を生み出しているのが、富士山の地質構造です。上部の水を通しやすい「新富士火山層（玄武岩）」を浸透した雨や雪解け水が、数十年から数百年という気の遠くなるような年月をかけて地下を伏流し、下部にある水を通しにくい「古富士泥流層」の境目へと到達します。その境目が崖面として露出しているのがこの地であり、地下水が崖一面から直接噴き出して滝を形成しているのです。
水温は年間を通じて約12℃前後に保たれており、夏は涼やかな冷気を、冬は白煙のような水蒸気を纏いながら澄み切った水を湛え続けます。この奇跡的な地質が生んだ絶景こそが、2013年に富士山世界文化遺産 構成資産の一つとして登録された決定的な理由です。
また、歴史的な由緒も極めて深く、建久4年（1193年）に源頼朝が富士の巻狩りを行った際、「これやこの 富士の雪解けの 白糸を たれてむすばぬ 人やなからむ」と歌を詠んだと伝えられています。さらに戦国時代末期には、富士講の開祖である長谷川角行が滝の裏の洞窟（霊岩洞窟）で水行を行ったとされ、信仰の聖地としても大切に守り継がれてきました。
