高校選択において保護者や受験生が最も注視する「出口の実績」において、沖縄水産高校は特筆すべき数値を叩き出しています。少子高齢化に伴う海運業界の人手不足を背景に、技術系学科に対する企業の採用熱は年々高まっています。
公式発表資料および進路指導部の集計によると、就職希望者の内定率はほぼ100%を維持。県内外の大型内航海運会社、官公庁船（水産庁・海上保安庁・水産試験場など）、マリーナ・リゾート企業、大手食品加工メーカーへの就職実績が際立っています。
さらに、高校卒業後に設置されている2年制の「専攻科」へ進学するルートは、海運業界を目指す生徒にとって最大のプラチナチケットです。専攻科を修了することで三級海技士（航海・機関）の国家試験筆記試験が免除され、通常の大卒・短大卒ルートに匹敵するスピードで大型外航船や外航客船の士官候補生としてのキャリアをスタートさせることが可能です。
総合学科からは、沖縄国際大学、名桜大学、沖縄大学などの県内私立・公立大学をはじめ、県内外の医療・看護系、調理・美容・情報系専門学校への進学、さらには自衛官や警察官、消防官といった公務員試験の現役合格者をコンスタントに輩出しています。
