2026年現在の通常運賃は、大人(中学生以上)2,000円前後、子ども(小学生)1,000円前後に設定されています(特別イベント便や春季ダイヤを除く)。チケットの購入は現地窓口での当日券購入も可能ですが、近年は公式予約サイトを通じた事前WEB決済がスタンダードとなっています。スマートフォン上で二次元コードを提示するだけでスムーズに乗船ゲートを通過できるため、窓口の列に並ぶ手間を省けます。
予約は乗船日の1〜2か月前から受け付けが開始されます。注意点として、台風や大雨による河川の増水、強風時には安全確保のため運休となるケースがあります。WEB予約を行っておけば、万が一の欠航時にも迅速なメール通知や自動返金処理が行われるため、リスク管理の観点からも事前予約の活用が強く推奨されます。