事態を重く見た当局は、公平な立場から検証を行うため「第三者調査委員会」を発足させた。弁護士や心理の専門家らで構成された同委員会は、生徒や教員への聞き取りを含めた包括的な調査を実施。その結果、一連の嫌がらせ行為が法律上の「重大事態」に該当すると正式に認定した。
特に大東市立大東中学校の組織的対応における「事なかれ主義」が厳しく批判された。学校現場での情報の抱え込みや、教育委員会への報告遅れが、被害の拡大を招いた直接的な原因だと指摘されている。報告書は、単に加害生徒の問題に帰結させるのではなく、学校システム全体の不全をクリアに突きつけている。