保護者や受験生が最も注目する出口戦略において、南平高校の進学実績は同ランクの都立高校と比較しても非常に堅実です。現役志向が非常に高く、卒業生の約8割以上が4年制大学へと進学を果たします。
とりわけ注目されるのが南平高校のMARCH合格実績です。明治大学、青山学院大学、立教大学、中央大学、法政大学への合格者数は毎年合計で100名〜150名規模に達し、学年の上位2〜3割に位置していれば十分に合格圏内を狙えるカリキュラムが整っています。さらに、国公立大学（東京都立大学、東京学芸大学、東京農工大学など）への合格者も二桁台を維持しています。
一般選抜だけでなく、東京都立南平高校の指定校推薦枠の充実ぶりも見逃せません。中央大学や法政大学をはじめとする難関私立大から成蹊・成城・武蔵・明治学院、日東駒専レベルまで幅広い推薦枠を保持しており、日頃の定期テストで評定平均4.0以上をキープし続けた生徒にとって有利な選択肢が用意されています。
