2026年大会の最大の特徴は、猛暑を避けるための「午前・夕方の二部制」運用が本格運用期に入ったことだ。日中の最も暑い時間帯を避けて試合が行われるため、選手の熱中症リスクは大幅に低減された。
しかし、トーナメント表の試合順によって、チームの調整サイクルには大きな差が生じる。早朝の第1試合に割り当てられたチームは午前4時台からのウォーミングアップが必要となり、逆に夕方の第3・第4試合のチームはナイター照明下でのプレイに適応しなければならない。試合間の待ち時間を含めた宿舎での過ごし方が、従来の甲子園以上に勝負の分かれ目となっている。