治療を開始する前に絶対に理解しておかなければならないのは、「一度変化が起きると、投薬を一切中止しても元に戻らない領域が存在する」という生物学的事実です。その最たるものが、女性化乳房や精子減少の不可逆的変化です。
女性ホルモンの刺激によって一度発達した腺組織（真性乳腺）は、投薬を中断しても萎縮・退縮することはあっても、完全に消失することはありません。男性の胸郭上に形成された乳腺を取り除くには、外科的な乳腺切除術を受ける以外に手段がなくなります。さらに重大なのが生殖機能の喪失です。長期にわたるエストロゲン投与は、精巣内のセルトリ細胞やライディッヒ細胞を不可逆的に変性させます。妊活部の医学レポートでも警告されている通り、無精子症となった精巣は、ホルモン投与を止めても精子形成能力が元に戻らない確率が極めて高くなります。将来的に血のつながった子どもを持つことを望む場合、初回投与前の「精子凍結保存」が絶対条件とされているのはこのためです。
一方で、ネット上で散見される「ホルモン注射を打てば女性のような声になる」という噂は完全な誤謬です。女性ホルモン注射で声が変わらない理由は、喉頭の解剖学的構造にあります。思春期の第二次性徴期において、テストステロンの作用で一度拡大した甲状軟骨（喉仏）や肥厚した声帯の靭帯組織は、エストロゲンをどれほど高濃度で投与しても縮小・薄型化することはありません。一度低音化した声を女性的な周波数へ変化させるには、専門的なボイストレーニングや声帯短縮手術といった物理的アプローチが不可欠となります。また、同様に顎や額などの骨格構造、毛根が完成している濃いヒゲについても、注射だけで消滅することはありません。
