亀田史郎氏を語る上で避けて通れないのが、日本ボクシングコミッション（JBC）から下された一連の重処分と、ボクシング界からの事実上の追放劇です。世間を震撼させた処分の背景には、主に2つの決定的な事件が存在します。
第一の事件は、2007年10月に行われたWBC世界フライ級タイトルマッチ（内藤大助 対 亀田大毅戦）です。試合中、劣勢に立たされた大毅選手に対し、インターバル中に「ヒジでもええから目に入れろ」といった反則を唆す指示を出した疑いが持たれました。この模様がテレビ生中継で全国に放映されたことで大バッシングに発展し、JBCは史郎氏に対して「セコンドライセンス無期限停止処分」を下しました。
第二の決定打となったのが、2010年3月のWBC世界フライ級王座統一戦（亀田大毅 対 フェルナンド・モンティエル戦）です。判定決着後の控室において、採点やレフェリングを巡りJBC役員や関係者に対して激しい暴言・威嚇行為を行ったと認定されました。この結果、JBC倫理委員会は「セコンドライセンスおよびトレーナーライセンスの取り消し（資格剥奪）」という、日本プロボクシング史上最も重い事実上の永久追放処分を決定したのです。
当時の報道や自著で語られた本人の述懐によれば、「息子たちを守るため、そして勝たせるために周囲すべてを敵に回す覚悟でヒール（悪役）を演じ続けた結果、感情のコントロールを失っていた」という葛藤が明かされています。過剰なメディアプロデュースと勝利至上主義の軋轢が生んだ、平成スポーツ界の大きな歪みであったと言えます。
