日本書紀の記述によると、皇極天皇3年（644年）冬、時の最高権力者であった蘇我蝦夷とその子・入鹿は、甘樫丘に並び立つように巨大な邸宅を築きました。蝦夷の館は「上の宮門（うえのみかど）」、入鹿の館は「谷の宮門（はざまのみかど）」と呼ばれ、子どもたちを「皇子（みこ）」と呼ばせるなど、天皇陵や王宮を凌駕する威勢を誇示していたと伝えられています。
なぜ蘇我氏は、この甘樫丘を本拠に選んだのか。その最大の理由は軍事的な要衝性と心理的な支配力にあります。甘樫丘は飛鳥盆地の西端に位置し、大和盆地南部への交通路を完全に扼する位置にあります。さらに、眼下には女帝・皇極天皇が座す飛鳥板蓋宮や、蘇我氏の氏寺である飛鳥寺が広がっており、文字通り「都全体を軍事的に見下ろし、威圧する」ための要塞宮殿だったのです。
しかし、その栄華は長くは続きませんでした。翌645年、飛鳥板蓋宮の儀式の場で入鹿が中大兄皇子（後の天智天皇）や中臣鎌足（後の藤原鎌足）らに暗殺される「乙巳の変」が勃発。入鹿の首が飛ぶ凶報を受けた父・蝦夷は、甘樫丘の館に籠城したものの軍勢に見捨てられ、自ら館に火を放って自害しました。この時、蘇我氏が所蔵していた貴重な歴史書『国記』などの大半が灰燼に帰したとされます。
近年の「甘樫丘東麓遺跡」の発掘調査では、7世紀前半から中頃の大規模な掘立柱建物跡や石垣、炭化物が混じる焼土層が相次いで検出されており、日本書紀に描かれた「焼き払われた豪邸」の実在を裏付ける決定的な物証として考古学ファンの注目を集め続けています。
