映画をどの順番で観るべきか迷っている場合、結論から言えば「公開順（第1作〜第5作）」での鑑賞がベストです。劇場版ケロロは独立したストーリーとして設計されているため、単体でも十分楽しめますが、テレビアニメ本編との連動を意識すると面白さが倍増します。
アニメ本編と映画の推奨時系列は以下の通りです。
- アニメ第1期〜第2期（第1話〜第103話）読了後：『超劇場版ケロロ軍曹』（第1作）を鑑賞
- アニメ第3期（第104話〜第154話）読了後：『超劇場版2 深海のプリンセスであります!』を鑑賞
- アニメ第4期（第155話〜第205話）読了後：『超劇場版3 天空大決戦であります!』を鑑賞
- アニメ第5期（第206話〜第256話）読了後：『超劇場版4 撃侵ドラゴンウォリアーズであります!』を鑑賞
- アニメ第6期（第257話〜第307話）読了後：『超劇場版5 奇跡の時空島であります!!』を鑑賞
テレビシリーズの各シーズン終盤で映画公開に向けた連動エピソード（プロローグやパロディ回）が放送されていたため、放送順に沿って視聴することで、当時のリアルタイムな熱量をそのまま体験できます。
