エキゾチックショートヘアの平均寿命は12歳〜15歳前後とされており、一般的なイエネコ全体の平均値と同等です。適切な栄養管理と定期的な健康診断、室内環境の整備を徹底することで、15歳を超えて元気に暮らす個体も多く見られます。
一方で、品種特有のかかりやすい疾患については十分な警戒が必要です。最も注意すべきは遺伝性疾患である多発性嚢胞腎（PKD）で、腎臓に嚢胞が多数発生して徐々に腎機能が低下します。現在ではDNA検査で保因の有無が判明するため、親猫の検査結果を確認することが最大の予防策です。
また、鼻腔が狭いことによる短頭種気道症候群や、浅い眼窩構造による角膜炎・流涙症、心筋が肥大化する肥大型心筋症（HCM）にも注意が求められます。特に夏季の温度管理は命に関わるため、室温は22℃〜26℃、湿度50%〜60%を基準に保ち、激しい運動による呼吸促迫を避ける配慮を徹底してください。
