豊臣秀吉が創始した「豊臣」という姓（本姓）は、朝廷から賜った公的な氏族名であり、秀吉の一族だけでなく徳川家康や前田利家など有力大名にも下賜されました。しかし、一族としてのアイデンティティと血統を現代に伝えたのは、正室ねねの実家である木下家でした。
ねねの兄・木下家定を祖とする足守木下家と日出木下家は、秀吉の威光とねねの庇護を受けつつも、関ヶ原の戦いや大坂の陣において巧みな政治判断を下し、徳川政権下で大名としての地位を維持しました。両家は明治維新まで改易されることなく続き、華族令によって子爵に列せられました。現在でも木下家の当主家は存続しており、高台寺をはじめとする秀吉・ねねゆかりの寺社行事や文化財保護に深く携わっています。
さらに、秀吉の弟・豊臣秀長の血筋もまた、女系を通じて力強く生き残りました。秀長の娘・大善院（おみや）は長州藩主・毛利輝元の養子である毛利秀元に嫁ぎ、その血統は長府藩主家を通じて萩藩（本家毛利家）や他の大名家へと広がりました。この女系ネットワークを通じて、秀長の血は現代の旧大名家・旧華族の家系へと確実に受け継がれています。
また、秀次切腹事件という悲劇に見舞われた関白・豊臣秀次の一族についても、生き残った娘・隆清院が真田信繁（幸村）に嫁ぎ、三男・三好幸信（真田幸信）を出産。その子孫は仙台藩重臣（仙台真田氏）として命脈を保ちました。このように、「秀吉の直系は滅びたが、豊臣一族を取り巻く遺伝子と記憶は多様なルートで現代に生きている」というのが歴史の真の姿です。
