最も有力視される生存説のひとつが、薩摩（現在の鹿児島県）への逃亡ルートである。島津家が大坂の陣の最中に秀頼やその子を救出し、薩摩の地に隠棲させたという伝説は、地元では今も根強く語り継がれている。
さらに、秀吉の正室・おね（高台院）の実家である木下家の家系図データを再検証する動きも活発だ。豊後日出藩（現在の大分県日出町）の木下家には、秀頼の落胤とされる求馬（のちの木下延由）をひそかに養子として迎え入れたという記録が存在する。密約によって幕府の追求を逃れ、大名の血筋として存続させたという説は、近年ますます現実味を帯びて語られるようになった。
近代以降の家系研究や遺伝学的な調査においても、これらの地域に根付く特定の家系が豊臣の家紋や特別な儀礼を現代まで継承している事実が指摘されている。秘められた血脈は、表の歴史の影で確かに息づいていたのかもしれない。
