道の駅いとまん お魚センターの営業時間は、基本的に午前9時（または10時）から午後18時頃までとなっています（各テナントにより開店・閉店時間に若干の前後あり）。品揃えが最も充実するのは、朝の水揚げと仕込みが整った午前10時30分から12時前後の時間帯です。
気になる糸満お魚センターの定休日とその理由ですが、施設全体としては原則「年中無休」で営業を行っています。これは、施設が国土交通省登録の「道の駅いとまん」敷地内に位置し、地域の食インフラとしての役割と、年中途切れることのない観光需要を一手に引き受けているためです。各店舗がシフト制や仕入れローテーションを組むことで、平日・休日を問わず鮮度の高い魚介を提供し続ける体制が整えられています（※台風などの荒天時や年末年始の一部期間を除く）。
