市場での人気が高まるにつれ、他地域産や質の低い模倣品が出回るという課題に直面した。これに対し、地元生産者と行政が一体となって立ち上がった。JA種子屋久や「種子島安納いもブランド推進普及協議会」が中心となり、品質基準の徹底した厳格化が進められている。
農林水産省による品種登録や地理的表示（GI）保護制度の活用をはじめ、出荷前の糖度検査や貯蔵期間の指定など、厳格なガイドラインが設けられた。収穫後に一定期間専用の貯蔵庫で熟成させる「熟成安納芋」のみが本物のブランド証を獲得できる仕組みであり、消費者に本物の感動を届けるための妥協なき姿勢がうかがえる。
