熊谷高校のもう一つの強力な柱が、文部科学省から指定を受けているスーパーサイエンスハイスクール（SSH）事業である。単なる受験特化型カリキュラムにとどまらず、最先端の科学的思考力と探究力を養うプログラムが全校規模で展開されている。
大学や研究機関と連携したフィールドワーク、生徒自らが仮説を立てて検証する課題研究、さらには英語での研究発表会など、その取り組みは極めて実践的だ。理数科の枠にとどまらず普通科の生徒にも門戸が開かれており、データサイエンスや先端技術への知見を日常的に深める環境が整っている。
暗記型学習の限界が指摘される現代の入試において、SSHで培われる「未知の課題に対して論理的に道筋を立てる力」は、二次試験の長文論述や総合型選抜においても破格のアドバンテージを生み出している。
