南京事件を巡る視覚的証拠として、書籍や展覧会、インターネット上で数多くの写真が紹介されてきました。しかし、近年の歴史学者や民間研究者による網羅的な写真検証によって、これらの中に少なからぬ「別事案の写真の誤用」や「キャプション（説明文）の改ざん」が含まれている実態が明らかになっています。
例えば、日中戦争初期の上海戦の写真、国民党軍による処刑風景、さらには1928年の済南事件における日本人被害者の遺体写真を「南京事件の犠牲者」として転載した事例が複数特定されました。当時、中国国民党軍事委員会政治部がプロパガンダ用に編纂した写真集『日寇暴行実録』などが戦後に無批判に引用されたことが原因とされています。
一方で、アメリカ人宣教師ジョン・マギー牧師が16ミリカメラで撮影した記録映像（マギー・フィルム）や、従軍した日本の報道関係者が撮影したスナップ写真などは、当時の南京城内外の状況を伝える真正な史料として認定されています。視覚資料の扱いには、綿密なキャプション検証とネガ・初出媒体の確認という厳格な史料批判が不可欠です。
