ゴッドクリーナーを体験した人が最も驚くのは、無色透明だった温水が時間の経過とともに濃い茶褐色や緑がかった黒色へと変貌していく光景です。水面には油膜のようなものや浮遊物が現れ、一見すると「足裏の汗腺から大量の老廃物が噴き出してきた」ように映ります。
この劇的な変色の主原因は、足裏から出る毒素ではなく電極カートリッジ内部で起きる電気分解と金属の腐食にあります。装置を作動させる際、水には導電性を高めるための微量な食塩（塩化ナトリウム）が投入されます。ここに直流電流を流すと、陽極（アノード）に使われている鉄や銅などの金属プレートが電気化学的に酸化され、金属イオンとなって水中に溶け出します。
溶出した鉄イオンが水中の酸素や水酸化物イオンと結びつくことで、赤サビの主成分である水酸化鉄や酸化鉄の微粒子が生成されます。これが水中に広がることで、濃い茶色やオレンジ色の濁りが発生するわけです。黒っぽい沈殿物や浮遊物も、金属の酸化状態や水質、塩分濃度に応じた無機化学反応の産物であることが分かっています。
