動物カフェにおいて最も重要なのは、人間側の都合ではなく動物福祉（アニマルウェルフェア）に基づいた安全管理です。ぷちまりーでは、猫たちの心身の健康を守るために明確なハウスルールが敷かれています。
第一に知っておくべきは、「無理な抱っこの禁止」です。ネット上の口コミで「抱っこできなかった」という感想が見受けられますが、これは店舗の厳格な方針によるものです。猫にとって不意の抱っこは強いストレスや恐怖心を与え、落下事故による骨折などのリスクを伴います。膝の上に乗ってくるのを自然に待つ、あるいはおやつやおもちゃで足元に誘導するのが正しいふれあい方です。
また、ファミリー層にとって重要な年齢制限・子供の利用基準についても配慮がなされています。多くの猫カフェが「中学生以上限定」と設定する中、ぷちまりーでは小学生以下の子どもでも保護者同伴（保護者1名につき未就学児〜小学生の人数制限あり）であれば入場可能な規定となっています。ただし、店内で大声を出したり、走ったり、寝ている猫を無理やり起こす行為は厳禁です。
撮影時の完全フラッシュOFF、手指のアルコール消毒、靴下の着用（または備え付けスリッパの利用）など、衛生面と安全面の基本マナーを徹底することが、猫たちから信頼される第一歩となります。
