2軍監督の年俸は12球団一律ではなく、各球団の資本力やファームへの投資姿勢によって一定のレンジがあります。特に3軍・4軍制を敷く福岡ソフトバンクホークスや、読売ジャイアンツ、阪神タイガースといった伝統的かつ資金力のある人気球団では、招聘する指導者の格に合わせて比較的高い年俸が提示される傾向にあります。
巨人の2軍監督には、阿部慎之助現1軍監督や桑田真澄氏のように、球団の看板を背負ってきたスター選手が配される事例が多く見られます。そうした著名OBを招聘する場合、解説者時代の収入やタレント価値も考慮され、相場の上限である3,000万円超が提示されるのが一般的です。
ソフトバンクにおいても、小久保裕紀現1軍監督が2軍監督を務めていた時期のように、将来のチーム再建を託すリーダーに対しては1軍首脳陣並みの評価が与えられます。一方で、財政面でシビアな球団では1,500万円前後に設定されることも多く、同じ「プロ野球の2軍監督」であっても球団の台所事情によって1.5倍から2倍近い開きが生じています。