奇脈の発生理由を理解するには、健常な身体における呼吸循環動態と、病的状態における「心室相互作用（Ventricular Interdependence）」の違いを把握する必要があります。
通常、息を吸い込むと横隔膜が下がり、胸腔内が陰圧になります。これによって大静脈から右心房・右心室への静脈還流（血液の戻り）が増加します。健常な心臓では、右心系に血液が増えても、心膜に十分な柔軟性があるため、右心室は外側に向かって自由に広がることができます。左心室の容積は圧迫されず、左室から全身へ送り出される血液量（1回拍出量）も大きく減少しないため、血圧の低下はごくわずかですみます。
一方、奇脈が生じる病態では、心臓を取り囲む「枠組み」が強固に固定されているか、あるいは肺内の圧力が異常に上昇しています。代表的な心膜疾患である心タンポナーデを例に取ると、メカニズムは以下の順序で進行します。
第一に、心膜腔内に液体が大量または急速に貯留し、心膜の内圧が極限まで跳ね上がります。第二に、吸気によって右心房・右心室へ血液が流れ込みますが、外側の心膜が押し広げられないため、行き場を失った血液は「心室中隔（右室と左室を隔てる壁）」を左室側へと強く押し出します（心室中隔の左方偏位）。第三に、左心室の拡張スペースが物理的に奪われ、左室充満不全に陥ります。結果として、左心室から大動脈へと拍出される血液量が激減し、吸気の瞬間に収縮期血圧が急激に降下するのです。
