ホテルエール滞在のハイライトと言えるのが、最上階（11階）に設けられた屋上露天風呂です。湯船に身を委ねると、目の前には別府湾のパノラマビューが広がり、天気の良い早朝には水平線から昇る幻想的な朝日を、夜には別府市街地の夜景と満天の星空を眺めながら湯浴みを満喫できます。
注がれる温泉は、敷地内の自家源泉から引かれた贅沢な天然温泉。ホテルエール別府の温泉泉質は肌への刺激が少ない弱アルカリ性の単純温泉（炭酸水素塩・塩化物泉系）で、湯上がり後の肌がしっとりと潤う「美肌の湯」として女性ゲストからも絶賛されています。10階の内湯でじっくり体を温めた後、階段を上がって屋上露天風呂の澄んだ外気に包まれる時間は、日常の疲れを芯から解きほぐしてくれる至福のひとときです。
