開設直後から凄まじいアクセス過多によって断続的なサーバーダウンを起こしていた公式サイトですが、公開からわずか数か月足らずで完全に閲覧不能となり、突如として閉鎖されました。
元少年Aの公式サイトが閉鎖された理由については、複数の要因が指摘されています。第一に、ネットユーザーからの通報が殺到したことによるレンタルサーバー会社側での規約違反（公序良俗に反するコンテンツ）によるアカウント凍結。第二に、ネット解析によって撮影場所や本人の潜伏エリアが特定されかけたことによる、元少年A自身の自己防衛的な削除です。
サイト本体は跡形もなく消滅したものの、当時のページデータはウェブ魚拓やインターネットアーカイブに保存されており、元少年Aが残した奇異なコンテンツは、デジタルタトゥーとして現在もネットの深部に記録され続けています。
