サンエー那覇メインプレイスの駐車場は、地下および3階・4階・屋上立体駐車場を合わせて約2,500台分が確保されており、駐車料金は完全無料です。しかし、この利便性の高さゆえに、土日祝日の13:00〜17:00や雨天時には施設周辺で激しい渋滞が発生します。
特に危険なのが、国道58号線方面から「おもろまち駅前交差点」を経由してメインエントランス（西側スロープ）へ直行するルートです。この導線は右折レーンの滞留とバスの運行が重なり、数百メートルの進入に30分以上を要するケースが散見されます。
混雑をスマートに回避するためのプロの進入・出庫ルートは以下の通りです。
- 進入時の裏ワザ：新都心公園側の東側道路（あっぷるタウン方面）からアプローチし、東側搬入口横のスロープから直接4階または屋上駐車場へ上がるルートを選択する。信号待ちが少なくスムーズに入庫可能。
- 駐車フロアの選び方：短時間利用なら地下駐車場が便利ですが、週末夕方の出庫時は地下スロープ合流部がボトルネックになりやすい特徴があります。帰宅時のスムーズさを最優先するなら、あえて屋上階に停め、東側スロープから下りる設計が最も出庫時間を短縮できます。
