思想家としての顔と並び、山本七平は優れたビジネス・組織論の指南役でもありました。中国唐代の名君・太宗の問答を編纂した『貞観政要』を日本的組織論へと翻訳・解説した『帝王学（貞観政要の知恵）』は、数多くの経営トップや政治家に愛読され続けています。
山本七平が説く帝王学の真髄は、「諫言（部下からの批判や直言）をいかに受け入れるか」というトップの自己抑制にあります。ワンマン化しやすい指導者が陥る罠を歴史の事例から解き明かし、組織を長続きさせるための統御術を平易な語り口で体系化しました。
さらに、江戸時代の思想家・鈴木正三や石田梅岩（石門心学）の精神を読み解いた『勤勉の哲学』では、日本人のプロフェッショナリズムの源泉を分析。労働を「苦役」ではなく「自己完成の道場」と捉える日本固有の職業倫理を再評価し、西洋的な資本主義論とは異なる日本的経営の土台を理論づけました。
