国立科学博物館を訪れる際、真っ先に押さえておくべきなのが国立科学博物館の予約方法と入館システムの最新運用です。かつての厳格な完全事前予約制から運用が柔軟化された現在でも、特別展の開催期や休日を中心に日時指定チケット（公式オンライン予約サイト「ART PASS」等）の事前取得が推奨されています。
混雑のピークは、土日祝日の11:00〜14:30に集中します。特に企画展示や上野科学博物館の特別展最新情報がメディアで話題になると、開館直後のチケットカウンターに行列が発生する傾向があります。現場の観覧動態データを分析すると、混雑をスマートに回避する有効策は「開館直後の9:00〜10:30」または「夕方15:00以降のレイト入場」です。
また、国立科学博物館へのアクセスは、JR上野駅「公園口」改札から徒歩約5分が最短ルートです。公園口改札を出て東京文化会館と国立西洋美術館の間の広場を抜け、交番を右手に直進すると、左手に巨大なシロナガスクジラの実物大モニュメントが見えてきます。東京メトロ銀座線・日比谷線上野駅（7番出口）や京成上野駅からもアクセス可能ですが、公園口からのアプローチが最も高低差がなくスムーズです。
