外来を受診する際、最も注意すべきなのは受付時間と初診の手順です。霞ヶ浦医療センター外来受付時間は、原則として平日の午前8時30分から午前11時00分までとなっています。土曜日・日曜日・祝日および年末年始は休診です。
初診時に他の医療機関からの紹介状を持参しない場合、健康保険による診療費とは別に霞ヶ浦医療センター紹介状なし初診料として国が定める選定療養費（7,700円）が自己負担として請求されます。これは病院が独自に設定したペナルティではなく、急性期医療機関への患者集中を防ぎ、救急や重症疾患の受け入れ態勢を守るための国の医療制度に基づいています。
また、かかりつけ医から予約を取ってもらう「地域医療連携予約」を利用すると、初診当日の受付手続きや待ち時間が大幅に短縮されます。予約の変更や問い合わせが必要な場合は、霞ヶ浦医療センター電話予約・変更専用窓口（平日の指定時間帯）へ連絡を入れる形が基本運用となっています。
