全国的な知名度を誇る人気店だけに、気になるのが明治亭の混雑状況です。特にゴールデンウィーク、お盆、紅葉シーズンの連休や週末のランチタイム（11:30〜14:00）は、1〜2時間待ちの行列が発生することも珍しくありません。
基本的にピークタイムの席の事前予約（明治亭の予約）は受け付けておらず、店頭の整理券発券機やウェイティングシートによる順番受付が主流となっています。混雑を巧みに回避するための鉄則は以下の3点です。
- 開店前の到着：ランチであればオープン時間の15〜20分前、ディナーであれば17時台前半の入店を狙う。
- アイドルタイムの活用：長野駅店や軽井沢店など通し営業を行っている店舗で、15:00〜16:30の閑散時間帯を狙う。
- 明治亭の持ち帰り（テイクアウト）：店内飲食が満席でも、テイクアウト用のお弁当であれば比較的スムーズに受け取り可能。
特にテイクアウトは、行楽地のピクニックや帰りの新幹線車内でゆっくり味わいたい旅行者にとって、時間を有効活用できる裏技として非常に重宝されています。
