幣立神宮の最大の特徴は、一般的な神社神道の枠組みを遥かに超えた、壮大な創世神話と古代伝承にあります。社伝によれば、その歴史は神武天皇の時代を遡ること約1万5000年前の神代にまで及び、「日本最古の神社」と称されています。
御祭神として祀られているのは、宇宙の根源神とされる神漏岐命（カムロギノミコト）・神漏美命（カムロミノミコト）をはじめ、大宇宙大和神（オオトノチオオカミ）、天御中主大神、そして天照大御神など。古事記以前の神々が名を連ねており、神社マニアの間でも異色中の異色と評される由縁です。
さらに特筆すべきは、幣立神宮が「人類発祥の地」とする伝説です。太古の昔、地球上に暮らす全人類の祖先がこの地に集い、世界の調和を祈り合ったと伝えられています。その象徴が、現在も受け継がれている「五色神祭（ごしきじんさい）」です。
五色神祭とは、赤人（赤色人種・アメリカ先住民など）、白人（白色人種）、黄人（黄色人種・アジア系）、青人（青色人種・オーストラリア先住民など）、黒人（黒色人種）という世界5大人種の代表が集い、平和と共生を誓った太古の儀礼を再現する神事です。毎年8月に例祭が斎行され、5年に一度の「大祭」には世界各国から平和を祈る人々が集い、民族や宗教の垣根を越えた祈願が捧げられます。
