八幡商業高校を語るうえで欠かせないのが、全国舞台で幾度となく旋風を巻き起こしてきた部活動の強豪ぶりです。
筆頭に挙げられるのが、春夏合わせて数多くの甲子園出場実績を誇る硬式野球部です。2011年夏の全国高校野球選手権大会では、9回裏2死から放った劇的な逆転サヨナラ満塁本塁打が高校野球ファンの記憶に今なお鮮烈に刻まれています。卒業生には、東北楽天ゴールデンイーグルスでエースや守護神として君臨する則本昂大投手をはじめ、プロ野球界や社会人野球のトップ戦線で活躍する逸材を多数輩出してきました。
もうひとつの看板が、全国制覇の常連であるカヌー部です。滋賀県の豊かな水環境を活かしたハードなトレーニングを重ね、インターハイ(全国高校総体)や国民スポーツ大会(国スポ)で幾度も全国優勝・メダル獲得を達成しています。日本代表クラスの選手も育てる指導体制は全国から高く評価されています。
さらに運動部のみならず、簿記部、ワープロ部、情報処理部といった商業系文化部も全国競技大会の常連であり、まさに「文武両道」を高い次元で具現化しています。