茶トラ猫を語る上で欠かせない「人懐っこさ」の正体を突き詰めると、単なる個体差を超えた猫の毛色と性格の遺伝的関係に突き当たります。遺伝学上、茶トラの鮮やかな赤褐色（オレンジ）を発色させるのは、X染色体上に存在する「O遺伝子（Orange gene）」です。この遺伝子の座所こそが、茶トラ猫の生態と性格形成を紐解く最大の鍵となっています。
哺乳類の性別は、メスが「XX」、オスが「XY」の性染色体の組み合わせで決定されます。O遺伝子は優性遺伝であるため、オス（XY）の場合は母親から受け継いだ1本のX染色体にO遺伝子が存在するだけで完全に茶トラとして発現します。一方で、メス（XX）が茶トラになるには両親媒の双方からO遺伝子を引き継ぐ（Oが2つ揃う）必要があり、確率論的に誕生数が極端に絞られます。その結果、茶トラ猫全体の約75%〜80%がオスという極端な性比の偏りが生じるのです。
一般に去勢済みのオス猫は、縄張り意識や外敵への警戒心が薄れると子猫のような依存心や甘え気質を生涯維持しやすい特徴を持っています。「茶トラ猫＝大らかな甘えん坊」という社会通念は、個体群の大部分を占めるオス特有の無邪気な行動パターンが強く反映された結果であると、近年の比較行動遺伝学の研究でも裏付けられています。茶トラという毛色そのものが甘えん坊を生み出しているというよりは、オス特有の心理傾向が茶トラというカテゴリー全体のイメージを牽引しているというのが科学的な真相です。
