表現者として圧倒的なオーラを放つ椎名林檎ですが、私生活では母としての顔も持ち合わせています。
2000年にギタリストの弥吉淳二氏（2018年逝去）と結婚し、男児を出産（のちに離婚）。その後、映像ディレクターの児玉裕一氏とのパートナーシップが広く知られており、現在はお子さんを育てる母親でもあります。
家庭人としての生活感がステージ上に持ち込まれることはほとんどありませんが、時折語られる子育てのエピソードからは、子どもたちへの深い愛情と責任感が伝わってきます。家庭人としての充実と地に足の着いた暮らしが、彼女のクリエイティビティと精神的な安定感を力強く支えています。
