ネット上の批判で頻繁に槍玉に挙げられるのが「学費の高さ」です。確かに、薬学部で6年間通えば総額で約1,200万〜1,300万円、健康メディカル学部の理学療法学科などでも4年間で約700万〜800万円に達します。この金額だけを切り取れば「高すぎる」という批判が生まれるのも無理はありません。
ただし、これは医療系私立大学としては極めて標準的な水準です。高度な医療機器を用いた実習環境、解剖学実習、専任医師・薬剤師による指導体制を維持するためには、どうしても莫大な設備投資と人件費が不可欠になります。一般的な文系学部と比較して「費用対効果が悪い」と断じるのは、業界の構造を無視した短絡的な見方にすぎません。
さらに注目すべきは、優秀層を取り込むための特待生制度（冲永学園奨学生制度等）の充実ぶりです。入試成績上位者に対して「初年度授業料全額免除」や「最長4年間の授業料半額免除」といった大胆なインセンティブが付与される枠が用意されています。中堅進学校で上位にいながら国公立大学の医療系に惜しくも届かなかった層が、この特待枠を勝ち取って実質的な経済負担を抑えながら進学するケースは珍しくありません。
安易に学費総額の数字だけに惑わされず、手厚い減免制度の適用要件や卒業後の生涯賃金（国家資格保有者の安定性）までを総合的に勘算する冷静な視座が求められます。
