東海大菅生を語る上で欠かせないのが、全国トップクラスの実績を刻み続ける部活動の存在です。特に硬式野球部と吹奏楽部は、全国の舞台で数々のドラマを生み出してきました。
甲子園常連の野球部とプロ野球選手輩出の実績
西東京大会で日大三高や早稲田実業といった強豪と鎬を削る硬式野球部は、春のセンバツ・夏の甲子園ともにベスト4やベスト8進出を含む輝かしい歴史を持っています。プロ野球界にも多数の人材を輩出しており、高橋優貴投手（元読売ジャイアンツ）や勝俣翔貴選手（元オリックス・バファローズ）をはじめ、大学・社会人野球の第一線で活躍するトッププレイヤーを継続的に育成しています。
一時期、週刊誌等で取り沙汰された監督交代の経緯や指導体制の変遷については、学園側が事実関係を精査した上で速やかにコンプライアンス遵守と指導体制の透明化を実施。新体制のもとでもチームの伝統である「機動力と粘り強い守備力」は継承され、現在も激戦の東京都大会で常に優勝候補の一角として君臨しています。
全日本吹奏楽コンクール常連！吹奏楽部の金賞実績
硬式野球部と並び、同校の看板となっているのが吹奏楽部です。全日本吹奏楽コンクール全国大会において通算複数回の金賞受賞を誇り、東京都代表の常連としてその精緻なアンサンブルと豊かな表現力は全国の吹奏楽ファンから極めて高い評価を得ています。定期演奏会や地域イベントでの演奏活動も精力的に行われており、部活動を通じて高い人間性を育む教育方針が根付いています。
