問題の重大性を受け、石川県高野連を通じて日本学生野球協会の審査室会議に事案が上程されました。下された金沢学院高校野球部への処分内容は、一定期間の「対外試合禁止処分」や関係指導者への謹慎処分など、厳しい措置を含むものでした。
対外試合禁止処分が科された直接の理由は、部内暴力および指導・監督責任の不徹底です。高校野球界では部員の暴力行為に対して極めて厳格な基準が設けられており、再発防止策が講じられるまでの公式戦・練習試合への出場が一切認められなくなりました。
この処分に伴い、直前に迫っていた公式戦の出場辞退を余儀なくされました。目標としていた大会への道を閉ざされた選手たちはもちろん、真面目に打ち込んでいた多くの部員にとっても計り知れない打撃となり、チーム全体が活動自粛という深い反省の期間を過ごすことになりました。