アルコール耐性を決定づける最大の要因は、肝臓に存在するアセトアルデヒド脱水素酵素（ALDH2）の活性タイプだ。日本人の約半数は遺伝的にこの酵素の働きが弱いか、あるいは全く機能しない体質を持つ。お酒を飲んですぐ顔が赤くなる「フラッシャー」と呼ばれる人は酵素の活性が低く、逆にどれだけ飲んでも顔色が変わらない人はALDH2が活性型（NN型）である可能性が高い。
また、女性特有の身体的構造も大きく影響する。女性は男性に比べて体内の水分量が少なく、脂肪割合が高いため、同じ量のアルコールを摂取しても血中濃度が上がりやすい。さらに、エストロゲンなどの女性ホルモンにはアルコール代謝を抑制する働きがあるため、月経周期や年代によってもお酒への強さが変動するという科学的根拠が存在する。
