三重県高校入試の難易度指標において、三重県立四日市南高等学校は県内公立校の最上位グループの一角を形成しています。模試実施各社の最新集計によると、四日市南高校 数理科学コース 偏差値は65〜66、普通科は61〜63で推移しており、北勢エリアでは四日市高校普通科（偏差値69〜70）の直下に位置する極めてタイトな競争帯です。
特筆すべきは、普通科と数理科学コースの間に存在する明確な難易度の壁です。数理科学コースは理数教育の拠点としてカリキュラムが特化されており、定員が1クラス（約40名）と狭き門であるため、毎年実質倍率が高止まりする傾向にあります。これに対し、普通科は募集定員が多いものの、四日市高校からの志願変更組や桑名高校普通科との間で揺れる学力層が集中し、安定した得点力が求められます。
取材に応じた大手進学塾の進路指導担当者は次のように証言します。「南高の数理科学コースを目指す層は、内申点・当日点ともに四日市高校普通科の下位合格層と完全に重複しています。一方、普通科の合格ボーダーは内申点のウェイトが極めて重く、中学校での定期テスト対策を怠った生徒が当日一発逆転を狙うには相当のリスクが伴います」。
